Het dijkversterkingsplan Nederlek heeft ter inzage gelegen van 6 september t/m 4 oktober 2004. In totaal zijn er circa 200 zienswijzen ingediend. De meeste hebben betrekking op de grondverwerving, de mogelijk optredende schade en het ontwerpplan. Ook zijn er zienswijzen ingediend op het milieueffectrapport (MER). Door een misverstand zijn er een aantal van deze zienswijzen niet opgenomen in de nota van beantwoording. Daarom wordt er een nieuwe nota opgesteld, waarin ook de zienswijzen op het MER worden beantwoord. Daarnaast zijn er zienswijzen ingediend, die betrekking hebben op de kapvergunning, de milieuvergunning, de sloopvergunningen etcetera.
Als gevolg van een aantal zienswijzen moeten de tekeningen worden aangepast en is er aanvullend onderzoek verricht. Dit laatste niet alleen door het hoogheemraadschap maar ook door de gemeente Nederlek, de provincie en een aantal andere instanties. Hier is veel tijd voor nodig (geweest). Een voorbeeld hiervan is het geluidsonderzoek dat nodig was om een ontwerpbeschikking af te kunnen geven voor het terrein Neef. Een tweede voorbeeld is de kapvergunning die het hoogheemraadschap voor een aantal bomen aanvroeg. De status van de aanvraag was dat bij de uitvoering alsnog werd gekeken of de boom kon worden gespaard, bijvoorbeeld door gedeeltelijk de kroon te snoeien. Echter bij te veel snoeien van de kroon en het afsnijden van de wortels wordt de boom bij storm instabiel waardoor hij kan omwaaien. Ook door een toetsing op veiligheid in het kader van de wet op de waterkering kunnen geen bomen op de dijk worden gehandhaafd. Er is één uitzondering gemaakt voor vijf monumentale bomen, die in het register van de bomenstichting in Utrecht zijn vermeld. Deze vijf bomen kunnen door het nemen van extra maatregelen worden gehandhaafd. Wel worden ze elke 5 jaar opnieuw op hun conditie beoordeeld.